人体的肠道内存在大量细菌、病毒和摄取的食物，即是外来的抗原。肠粘膜通过免疫性机制构成“粘膜屏障”，阻止抗原进入体内或控制机体对侵入抗原的免疫反应。
如果这些粘膜屏障作用减弱或丧失，抗原便进入人的体内，激发人体产生主要为lgE型的抗体，人体的肥大细胞和嗜碱粒细胞表面有高亲和力受体，能结合lgE抗体，一旦暴露于相应抗原后，便引起不同类型的胃肠疾患，临床上统称为过敏性腹泻。
食物过敏症主要是乳蛋白和大豆蛋白过敏，牛奶中至少含有20种抗原性蛋白，资讯儿童约0.3%-0.7%对牛奶过敏，而有过敏体质的儿童约30%对牛奶过敏。
