肛门疼痛主要是指肛门内以及肛门直肠周围疼痛为主的一种症状，为多种肛门直肠疾病所共有。如肛裂、肛窦炎、血栓性外痔、肛管直肠恶变、肛旁脓肿、内痔嵌顿、外痔水肿以及肛门异物损伤等。而其疼痛的性质、程度以及伴随症状各有所异。
⑴肛裂 疼痛呈周期性，多发于大便时或大便后，主要由粪便刺激，溃疡裂口扩张所致。其疼痛为阵发性灼痛或刀割样疼痛，可持续数分钟；待粪便通过后，疼痛减轻。另外，由于排便的刺激，内括约肌可呈持续性痉挛，引起溃疡裂口剧烈而持久的疼痛；往往可持续数小时之久，患者坐卧不安，十分痛苦；严重者可疼痛24小时以上。除了疼痛，肛裂者常伴有出血、便秘等症状。
⑵肛窦炎 一般为肛门部微痛、坠胀，排便时因粪便压迫发炎的肛窦而致肛门部灼痛，若括约肌因受刺激而挛缩，疼痛则加剧，并向臀部及股后部放射。常伴有少量脓性或粘液性分泌物外溢、气味臭，日久可致肛周潮湿、瘙痒等不适。
⑶血栓性外痔 轻者有异物感，大多伴有胀痛。由于肛周静脉血管破损，血块凝结而成血栓，在肛门外皮下出现青紫圆形硬结节。
⑷直肠恶变 早期无疼痛，以后由于肿块增大破溃，可出现肛门部坠胀、隐痛，常见有大便习惯改变、脓血便、腹胀、腹痛、消瘦等症状。患者若有上述症状，要及时请专科医生诊断、治疗。
⑸肛旁脓肿 以胀痛为主，酿脓时疼痛呈鸡啄样。由于肛旁脓肿的发生部位、脓肿大小、致病菌和患者机体抵抗力等种种因素不同，出现的症状和体征也各有异。常见的有肛门周围皮下脓肿、坐骨直肠窝脓肿、骨盆直肠窝脓肿、直肠后脓肿，以及结核性脓肿等。这些脓肿除主要症状有所不同外，一般均半有发热、寒战、便秘、排尿不畅等。与其他部位不同的是约90%以上的肛旁脓肿可形成肛瘘，病程较长。
⑹内痔嵌顿 以胀痛、灼痛为主，多由于痔静脉曲张、血络破损、血栓形成，造成组织循环受限而脱出肛门外，无法回纳，好发于Ⅱ、Ⅲ期内痔。故需尽早回纳或手术治疗，否则表面粘膜极易出血、破损，甚至并发感染。
⑺外痔水肿 以坠胀、灼痛为主，表现为肛门边缘局限性肿块，质硬、光滑、晶亮、触痛明显。多由于劳累，大便时努挣或手术刺激等造成。
⑻肛门异物损伤 多为外伤异物残留或饮食不当，鱼刺、骨片嵌插肛管直肠所致，故需请医生仔细检查，取出异物，疼痛即能缓解。若滞留时间过长，可引起局部感染。
此外，肛门直肠神经官能症 阴部神经症候群、直肠炎症等均可引起肛门直肠疼痛，临床上常需注意，加以鉴别。
以上⑴、⑵、⑸、⑹多为排便时疼痛；⑶、⑷、⑺、⑻多为持续性疼痛；其余为间隙性疼痛。肛门疼痛是最常见的症状之一，故要明确诊断，寻找致病原因，审因施治。否则非但不能解除痛苦，还将延误治疗。
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